Simulação computacional da interação entre um fármaco e uma proteína

Nesta atividade os alunos usam computadores para aprender a a) desenhar estruturas moleculares de compostos orgânicos, b) gerar estruturas 3D, c) aceder a bases de dados de macromoléculas e d) gravar as moléculas em ficheiros com formatos químicos. Estas tarefas utilizam software ChemAxon e Pymol. As estruturas moleculares obtidas são usadas para a simulação da interação entre uma molécula pequena (fármaco) e um recetor macromolecular (enzima). Os resultados são analisados através de visualização das geometrias obtidas e das estimativas das energias de interação.